음 제가 정확히 질문을 이해했는지 모르겠는데요.
이해한 데로 답변을 드려보겠습니다.

a.php

$var_a = array('a1', 'a2', 'a3', 'a4', 'a5', 'a6', 'a7', 'a8', 'a9', 'a10');

include "b.php";

for ($i=0; $i<10; $i++) {
	$foo[$i]['a'] = $var_a[$i];
	$foo[$i]['b'] = $var_b[$i];
}

$tpl->define(array(
	"t_id" => "a.skin.html"
));

$tpl->assign(array(
	"foo" => $foo
));

$tpl->print_('t_id');

b.php

$var_b = array('b1', 'b2', 'b3', 'b4', 'b5', 'b6', 'b7', 'b8', 'b9', 'b10');

a.skin.html

<!--{@ foo}-->
	변수 var_a의 값은 {.a}입니다. <br>
	변수 var_b의 값은 {.b}입니다. <br>
<!--{/}-->

위와 같이 처리하면 될 것 같습니다.
참고로 될 수 있으면 반복문 (for, foreach, while, do while) 안에서는 include 나 require 를 사용하지 않는 것이 좋습니다.

감사합니다.