네 무슨 말씀인지 이해했습니다.

직접적으로 작업한 php파일을 url호출하는 방법은 따로 지원하지 않고 있습니다.
만일 직접 호출한 것과 같은 동일한 결과를 얻기 위해서는 이윰빌더의 page 시스템을 이용하면 될 것으로 보입니다.

1. /eyoom/core/page/index.php 파일 수정 - 위와 같은 요구가 있을 것으로 판단되어 다음 버전에 반영하도록 하겠습니다.
[수정전]

if(!$pid) alert('잘못된 접근입니다.');
else {
	$pid = str_replace("|","/",$pid);
	$page_file = $pid.'.html';
	$file_path = EYOOM_THEME_PATH.'/'.$theme.'/page/'.$page_file;
	if(!file_exists($file_path)) {
		alert('해당 스킨파일이 존재하지 않습니다.');
		exit;
	} else {
		// 코어 프로그램 프로그램 연동할 수 있도록 추가
		@include_once(EYOOM_CORE_PATH.'/page/'.$pid.'.php');
		
		// 사용자 프로그램
		@include_once(EYOOM_USER_PATH.'/page/'.$pid.'.php');

		$tpl->define(array(
			'pc' => 'page/' . $page_file,
			'mo' => 'page/' . $page_file,
			'bs' => 'page/' . $page_file,
		));
		$tpl->assign(array(
			//'page' => $page,
		));
		@include EYOOM_INC_PATH.'/tpl.assign.php';
		$tpl->print_($tpl_name);
	}
}

[수정후]

if(!$pid) alert('잘못된 접근입니다.');
else {
	$pid = str_replace("|","/",$pid);
	$page_file = $pid.'.html';
	$file_path = EYOOM_THEME_PATH.'/'.$theme.'/page/'.$page_file;

	// 코어 프로그램 프로그램 연동할 수 있도록 추가
	@include_once(EYOOM_CORE_PATH.'/page/'.$pid.'.php');
	
	// 사용자 프로그램
	@include_once(EYOOM_USER_PATH.'/page/'.$pid.'.php');

	if(file_exists($file_path)) {
		$tpl->define(array(
			'pc' => 'page/' . $page_file,
			'mo' => 'page/' . $page_file,
			'bs' => 'page/' . $page_file,
		));
		$tpl->assign(array(
			//'page' => $page,
		));
		@include EYOOM_INC_PATH.'/tpl.assign.php';
		$tpl->print_($tpl_name);
	}
}

2. /eyoom/core/page/test.php 문서 작성 - DB 작업 html 과 프로그램 내용이 혼재되어 있어도 무방합니다.
--예제--

<?php
if (!defined('_GNUBOARD_')) exit;

$sql = "select mb_name from {$g5['member_table']} where (1) order by mb_datetime desc limit 1";
$latest_member = sql_fetch($sql, true);
?>

<div>
	<h3>가장 최근 가입한 회원</h3>
	<div>
		가장 최근에 회원가입하신 회원의 이름은 <strong><?php echo $latest_member['mb_name'];?></strong> 입니다.
	</div>
</div>

3. 해당 문서의 URL 은 아래와 같습니다.

http://yourDomain/page/?pid=test

위와 같이 처리하시면 메뉴등록 문제도 해결됩니다.
감사합니다.